Alle digitalisierten Dokumente werden in einer Datenbank gespeichert. Diese Dokumente sind unveränderlich und können nicht gelöscht werden. Das Löschen von Dokumenten ist jedoch für autorisierte Benutzer möglich, beispielsweise aus Gründen wie dem Erreichen von Ablauffristen oder aufgrund fehlerhafter Vorgänge.
Die Datenbank wird automatisch regelmäßig gesichert. Es ist jedoch ratsam, zusätzlich eine externe Sicherung der Datenbank vorzunehmen. Hierfür empfiehlt sich eine Sicherung in einem Cloud-System. Die Sicherung auf einem physischen Datenträger ist insofern unpraktisch, da dieser gegen Verlust (Diebstahl, Feuer, Wasser oder mechanische Zerstörung) geschützt werden muss.
Im Falle eines Bedarfs kann die gesicherte Datenbank mithilfe der DMS-Software wiederhergestellt werden und entspricht dabei allen gesetzlichen Vorgaben.